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产品详情

BTN101104 3′RACE试剂盒

  • 产品/服务:BTN101104 3′RACE试剂盒
  • 型 号:BTN101104
  • 品 牌:百奥莱博
  • 单 价:面议 
  • 更新日期:2023-05-31
  • 有效期至:长期有效
  • 浏览次数:927
产品简介

3′RACE试剂盒是高品质的基因结构和功能产品,由北京百奥莱博供应,本产品仅用于生物化学研究方面,本产品质量好,且具价格,深为用户称道,了解更多3′RACE试剂盒等基因结构和功能产品请联系我司咨询订购。...

产品详细介绍

特别提示:包括3′RACE试剂盒在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!


产品名称:3′RACE试剂盒
英文名称:3′-RACE Kit
产品货号:BTN101104
产品规格:10次

研究真核基因的zuì基础的工作之一就是确定其转录终止位点,目前zuì通用的方法是3′-RACE法,RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)是Frohman发明的、通过PCR快速克隆cDNA末端的技术,它在不建立cDNA文库的前提下,利用已知cDNA序列设计引物,通过往两端延伸和扩增获得其3′-端序列。本试剂盒就是根据3′-RACE原理而开发。RACE的原理如下图:
RACE的原理图

产品特点:
1. 即开即用,客户不需要单独准备各种材料。
2.反应条件经过精心优化,包括使用无RNase H活性的MMLV和优化的引物。

试剂盒组成:
成分 规格
MMLV逆转录酶-RI混合物(RNase H-,200U/μL) 10μl
MMLV Buffer(含dNTP) 50μl
PCR MagicMix 2.0(含酶和染料) 1.5ml
3′-RACE引物A(10μM) 10μl
3′-RACE引物B(10μM) 100μl
3′-RACE引物C(10μM) 100μl
RNase-Free水 1ml
说明书 1份


储存条件:低温运输、-20℃保存、有效期一年。

使用方法:

一、利用含Oligo(dT)的3′-RACE引物A进行逆转录
 注意:MMLV酶使用前必须短暂离心,因为它含50%甘油,及其粘稠,否则将取不到所需体积。
1.在一个PCR管中,加入以下组分:
成分 用量
Poly(A)RNA(或总RNA) 0.2-2μg(5μg)
3′-RACE引物A(10μM) 1μL
MMLV Buffer(含dNTP溶液) 5μL
RNase-Free水 补至19μL
合计 19μL

 注意:如果可能,zuì好使用Poly(A)RNA作为模板。
  65℃保温5分钟,展开RNA的二级结构,立即冰浴待用。
2. 再在上述PCR管中加入1μl MMLV逆转录酶-RI混合物(200U/μL)。
3. 37℃保温60分钟,42℃保温30分钟进行逆转录反应;然后50℃保温10分钟终止反应。
4. 加入0.5mL RNase-free水稀释上步得到的cDNA,冰浴待用。长期放置需要放-20℃保存。

二、利用基因专一性引物A和3′RACE引物B进行轮PCR
5. 用不同量的RT反应液(稀释后的cDNA)设置PCR(样品组zuì好设置用量梯度,单位:μL)。
成分 梯度1 梯度2 梯度3 梯度4
稀释后的cDNA 1 5 10 15
基因专一性引物A(10μM) 2.5 2.5 2.5 2.5
3′RACE引物B(10μM) 2.5 2.5 2.5 2.5
98℃ 5分变性RNA-cDNA杂交链,短暂离心后再加入下列成分
PCR MagicMix 2.0 25 25 25 25
RNase-free水 19 15 10 5
合计 50 50 50 50

6. 按下列条件进行PCR(注:应根据实际情况选择适当的退火温度)。
 第1次循环:52-60℃ 2分,72℃ 40分(此步的目地是合成第二链的cDNA,复性温度需要根据自备基因专一性引物A的Tm值进行优化,一般可以从55℃开始)。
 第2-30次循环:94℃ 1分钟,52-60℃ 1分,72℃ 3分(此步为PCR扩增,复性温度需要根据自备基因专一性引物A的Tm值进行优化,一般可以从55℃开始)。
 zuì后延伸:72℃ 15分
7. 取5μl的PCR反应液进行琼脂糖凝胶电泳以确认PCR扩增产物。若得到目的扩增产物需要用于后续实验,请于-20℃保存;若没有得到目的扩增产物,可按下列步骤进行巢式PCR反应。

三、利用基因专一性引物B和3′RACE引物C进行巢式PCR反应
8. 将上轮PCR产物(4管)均用水稀释稀释20倍,然后每管均用巢式PCR进行扩增。巢式PCR反应设置如下:
成分 用量
PCR MagicMix 2.0 25μl
上步得到的PCR反应液(稀释20倍后) 1μl
基因专一性引物B(10μm) 2.5μl
3′RACE引物C(10μm) 2.5μl
超纯水 补至50μL

9. PCR反应。按下列条件进行PCR:
第1-30次循环:94℃ 1分钟,52-60℃ 1分,72℃ 3分(复性温度需要根据自备基因专一性引物B的Tm值进行优化,一般可以从55℃开始)zuì后延伸:72℃ 15分
10.电泳检测。然后根据实验结果进行DNA测序或TA克隆。

注意事项:
1. 如果两轮PCR得到的非特异产物多,可以在RT反应是继续降低3′-RACE引物A的用量。
2.自备的基因专一性引物的GC含量zuì好跟3′-RACE引物B和引物C的一致,后者长度均为18nt,均含11个G(或C),7个A(或T)。

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名称:Acetylcholinesterase/ACHE mRNA原位杂交试剂盒
货号:ZN0013
规格:100T
基本信息:
保存条件:4℃保存一年
工作量:100张切片。
有效期:一年。
适用种属:human,rat,mouse,rabbit
标记方式:3’—尾段标记
标记方式:3’—尾段标记
试剂盒中内容:
1.胃蛋白酶(×10; Pepsin)2ml;
2.预杂交液 2ml;
3.Acetylcholinesterase/ACHE mRNA原位杂交试剂盒寡核苷酸探针杂交液 2ml;
4.封闭液 5ml;
5.生物素化鼠抗地gāo辛 5ml;
6.SABC-POD 5ml;
7.生物素化过氧化物酶 5ml。
用户自备试剂:
原位杂交专用盖玻片;POLY-L-LYSINE;DEPC;20%甘油
缓冲液(3%柠檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,原位杂交用 PBS)
一.培养细胞和冰冻切片
准备工作:
固定液:4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6);1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6)
3%柠檬酸——100ml蒸馏水中加柠檬酸(C6H8O7•H2O)3g,PH2.0左右。
2×SSC——1000ml蒸馏水中加氯化钠17.6g,柠檬酸三钠(C6H5O7Na3•2H2O,分子量294)8.8g。
0.5×SSC——300ml蒸馏水加100ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸馏水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸馏水即可。
原位杂交用PBS(1000ml蒸馏水加氯化钠30g,Na2HPO4•12H2O 6g,NaH2PO4•2H2O 0.4g),PH7.2-7.6。
操作程序:
注意:zuì重要的是及时固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC处理,以抑制RNA酶对mRNA的分解作用。此外,过度固定对原位杂交有明显的不利影响。
1.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸或APES。切片厚度10-20μm。
2.细胞在多聚赖氨酸处理的盖玻片上进行培养,条件为37℃和5%的CO2,所用培养基为Dulbecco基础培养基。细胞长好后0.1M PBS(PH7.4)洗2分钟×3次。
3.培养细胞和冰冻切片均可用下述方法固定:固定液为4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室温固定 20--30分钟。蒸馏水充分洗涤,干燥后-20℃冰冻可保存2周以上。
4.30%H2O2 1份+纯甲醇50份混合,室温处理30分钟。蒸馏水洗涤3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3% 柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃或室温消化5—120秒钟。有时也可以不消化。原位杂交用 PBS洗3次×5分钟。蒸馏水洗1次。
6.后固定:胃蛋白酶消化后才需要。固定液为1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室温固定 10分钟。蒸馏水洗涤3次。
7.预杂交:湿盒的准备——干的杂交盒底部加20%甘油20ml以保持湿度。按每张切片20μι加预杂交液。恒温箱38-42℃2—4小时。吸取多余液体,不洗。
8.杂交——按每张切片20μι杂交液,加在切片上。将原位杂交专用盖玻片的保护膜揭开后,盖在切片上。恒温箱38-42℃杂交过夜(根据杂交情况可以调节)。
9.杂交后洗涤:揭掉盖玻片,37℃左右水温的2×SSC洗涤5分钟×2次;37℃0.5×SSC洗涤15分钟×1次; 37℃0.2×SSC洗涤15分钟×1次(如果有非特异性染色,重复0.2×SSC洗涤15分钟×1-2次)。
10.滴加封闭液:37℃30分钟。甩去多余液体,不洗
11.滴加生物素化鼠抗地gāo辛:37℃ 60分钟或室温120分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×4次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
12.滴加SABC:37℃20分钟或室温30分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×3次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
13.滴加生物素化过氧化物酶:37℃20分钟或室温30分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×4次。
14.DAB显色:使用DAB显色试剂盒—1ml蒸馏水加显色剂A,B,C各一滴,混匀,加至标本上。一般显色20-30分钟。若无背景出现则可继续显色。也可自配DAB显色剂后显色。充分水洗。
15.必要时苏木素复染,充分水洗。
16.酒精脱水,二甲苯透明,封片。
二.石蜡切片
如果有条件的话,应尽可能地采用新鲜标本。标本离体后,及时予以固定。固定液为4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC。标本较大时用刀片切成厚度不超过4mm的小块,固定1小时即可,较大的标本固定不要超过2小时。某些组织对过度固定尤其敏感,如动物大脑,固定时间30-40分钟,一般不要超过1小时。
1.常规脱水、浸蜡、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸或APES。
3.石蜡切片经常规脱蜡至水。30%H2O2 1份+蒸馏水10份混合,室温5-10分钟以灭活内源性酶。蒸馏水洗3次。
4.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3% 柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃或室温消化3--30分钟(视标本新旧、厚薄自行调整)。用户可以比较不同的消化时间,例如5分钟,10分钟,20分钟,30分钟。以找到zuì佳的消化时间。原位杂交用PBS洗3次×5分钟。蒸馏水洗1次。其余步骤和冰冻切片6-16步相同。
结果观察:
Acetylcholinesterase/ACHE的细胞胞浆着色呈棕黄色。
注意事项:
由于特定的mRNA序列仅占总mRNA的少数,加上基因仅由四个碱基排列组合而成,因此原位杂交容易出现非特异性染色。通过不加探针和用阴性标本做对照,基本可以确定染色是否为特异性的。有明显的非特异性染色现象时,用预杂交液对含探针的杂交液进行稀释,一般稀释2—10倍;并应加强探针杂交后的洗涤。如果有少量的细胞核着色属于正常情况;如果出现大量的细胞核着色,往往和标本固定时间过长有关,应重新处理标本。

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