微生物鉴定中的生理生化试验代谢，在所有活细胞中存在的全部生物化学反应称之为代谢，代谢过程主要是酶促反应过程。各种微生物具有不同的酶系统，利用的底物不同，或虽利用相同的底物但产生的代谢产物不同，因此可以利用各种生理生化反应来鉴别不同的细菌，尤其是在肠杆菌科细菌的鉴定中，生理生化试验占有重要的地位。

   常用的微生物生理生化反应方法有大分子物质水解试验、糖发酵试验、吲哚、甲基红、伏-普、柠檬酸盐试验等多种。

    微生物生理生化鉴定现多用微生物微量发酵管，其操作方法是将微量发酵管一端距离内容物上方2 cm处用砂轮划开，并迅速将划开处置于酒精灯火焰处消毒，无菌操作勾取斜面保存的菌株接入发酵管中，然后用无菌胶布封口，利用恒温培养箱培养并观察结果。根据实验结果的不同，从而鉴定出不同的微生物种类。

但传统方法存在以下缺点：

（1）反复勾取菌种易污染原菌株。

（2）反复灼烧接种环，酒精、接种环损耗严重。

（3）实验耗时长，尤其是当需鉴定的发酵管达20～30种时。

（4）每次的接菌量不确定，时多时少，易产生实验误差。

（5）操作繁琐，耗费时间较长。