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两种RT-qPCR方法的优缺点比较

发布时间:2020-06-09浏览次数:1187返回列表

实时聚合酶链反应(PCR)是基于PCR的革命性方法,这一技术是PCR高灵敏度和实时检测相结合的结果。实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)的独特特征就是把目的基因的扩增与荧光信号联xi起来,并将其量化。 在定量基因表达分析,目前有两种方法zui受欢迎, SYBR Green and TaqMan,那么这两种哪个geng好呢?本文分别分析其优缺点。

一、荧光染料法(SYBR Green)

其原理是:在PCR反应体系中加入过量荧光染料,DNA扩增的过程中,荧光染料特异性地掺入DNA双链,发射荧光信号,随着反应的进行,荧光强度逐渐增强,并且可以实时测量。如果你要扩增你的目标样品40个循环,在zui后一个循环结束时检测到的荧光会比在第10个循环测得的荧光强很多。

优点:

    成本较低,适合大规模的实验。

    在实验设计阶段非常省时,因为它只需要合适的引物设计。

缺点:

    特异性不是很高。染料可以插入任何双链DNA,包括引物二聚物和非特异性产物。

    如果引物二聚体存在或者产物受到污染,得到的结果会不可靠。

    geng容易与低丰度的目标产生非特异性荧光。

    需要geng多的时间进行结果分析。

二、寡核苷酸探针(Taqman)

这种方法涉及使用荧光标记的寡核苷酸(短DNA分子),探针通常在5 '端和3 '端都被标记。

在探针的5’端有报告基团,3’端设计淬灭基团,当报告基团接近淬灭基团时,不会检测到荧光信号。RT-qPCR反应时,寡核苷酸两个基团分离,即可检测到荧光信号,并与PCR产物同步。

使用这种方法的荧光检测依赖于两个过程:1)引物与目标序列的结合(2)探针与引物下游

互补序列的结合。

优点:

    geng有可能只放大所需的产物,由于引物和探针的结合具有特异性。

    不需要解离曲线,只有探针与正确的目的序列结合时才能检测到荧光。

    由于具有特异性,数据geng可靠。

    数据分析时节省时间。

缺点:

    需要大规模实验时耗费成本高。

    需要geng长的时间来设计实验,因为需要好的引物和探针。

总的来说,这两种荧光检测方法都很有效,但对于你的具体实验,可以选择适合的方法