HPLC 优点：高压 速度快 分析精度高 所需样本量少，主要用于分析 纯化多肽类

缺点：柱子较贵 有些需要用乙氰甲醇等有毒有害 试剂不能或只能纯化 很小量的蛋白

AKTA 系统 优点： 中低压 容易放大 可大规模纯化蛋白类 常规只用无机盐类 试剂 可配备各种介质纯化不同蛋白 可自己灌胶 费用较少

缺点：分析精度没有HPLC高

选用HPLC或AKTA的FPLC主要是依据你的用途而买，分析用HPLC ,大规模纯化用FPLC

FPLC供小量（小于explorer)制备用，大流速只有20ml/min。

HPLC基本是用做分析用，也可用做微量制备。

AKTA和HPLC市场定位是不一样的。从而在从硬件到软件的功能侧重点都各有所长。

样品制备和工艺研究：AKTA 100ml 系列，常用于新药研发机构

兼顾制备和要求不高的分析：AKTA 10ml 系列，常用于科研单位

要求较高的分析，可兼顾少量制备：HPLC 系列，常用于分析测试及科研单位