PCR扩增仪可以将反应管加热或冷却到每步反应所需的的温度。为防止反应体系中液体产生蒸气，通常在反应管上加盖加热的盖子(比加热板温度来的高)，或者在反应体系表面加入一层石蜡油。作为实验室的常用仪器，其选用问题不容忽视， 关于PCR扩增仪的选购，您需要知道这些！
1、的温度控制系统
对PCR仪来说，温度控制指标主要是指温度的准确性、均一性、以及升降温速度。
温度的准确性：是指样品孔温度与设定温度的一致性，它直接关系到实验的成败。由于PCR是一个几何级数扩增的过程，不论是变性、退火还是延伸都需要准确控制温度，对退火温度而言温控显的尤为重要，有时1°甚至0.5°的差异也能决定实验的成功与失败，所谓差之毫厘，谬之千里。因而对PCR扩增仪而言温度控制就意味着质量。
温度的均一性：是指样品孔间的温度差异，它关系到在不同样品孔进行反应结果的一致性。有用户发现用同样的样品，同样的PCR反应程序，后的结果竟然差异非常明显，或许就是因为不同位置的温度不均匀所致。同时位置边缘效应对PCR实验可重复性影响非常明显。
升降温速率：快的升降温速度，可以缩短反应进行的时间，而且缩短了可能的非特异性结合、反应的时间，能提高PCR反应的特异性。eg:HealForce T960 PCR仪标配升降温速度高达5℃的镀金模块，是同类厂家中配置镀金模块的。
2、仪器的功能性和人性化设计
越友好的操作界面、完善的功能以及人性化的设计能吸引用户。（热盖、样品座、软件）
热盖：现在的PCR仪一般均配备热盖，热盖温度设为105℃，使样品管顶部的温度达到105℃左右，蒸发的反应液就不会产生凝集在管盖上而改变反应体积，这样用户就无需再向反应管内加石蜡油，直接减少后继反应的麻烦。HealForce热盖温度范围为：20-110℃。
样品座：PCR反应多在0.2或者0.5的管子中进行，多数PCR仪也配备了不同的可换样品槽适配不同的样品管。HealForce PCR仪一个槽内带有0.2和0.5两种不同样品孔，不需换基座就可以分别使用两种不同的反应管，或者96孔板，避免了换基座的麻烦。
软件：新的PCR仪都比较注重程序编写的简易性。大屏幕，显示实时信息，，记忆存储多个程序、自动断电保护等都有助于实验室中的复杂环境使用。